PC-9801が登場して1年後の1983年11月にはモデルチェンジが行われ、EモデルとFモデルが登場します。Eモデルはフロッピー外付け、Fは2DDのFDDを 搭載したもので、F1/F2/F3がラインされました。Mモデルは1984年12月に登場したもので、2HDのFDDを搭載しており、M2とM3がありました。
バージョンアップされた内容は
E/F/Mとも、ビデオRAM（VRAM）が2倍に増えて192KBに増設されました。これにより、グラフィックスの画面数が倍に増えましたが、以降対応ソフトウェアは初代機非対応のものが多くなります。PC-9801用ソフトが無印/U2を除くとよく書かれているのはこのためです。
デザインでは、初代機のごつい感じがなくなって、かなりすっきりした感じになっています。
PC-9801E/F
Eは主に外付けフロッピードライブを利用する人向け、Fは2DDのフロッピードライブを内蔵するモデルで、1台組み込みはF1、2台組み込みはF2 で、F1には追加できるように組み込み用ドライブが用意されています。また、Eは漢字ROMはオプション、Fは第一水準漢字ROM標準搭載となっていま す。拡張スロットはEは6個、Fは4個搭載されています。Fシリーズにはハードディスク内蔵モデルのF3もあり、こちらはハードディスク1台とFDD1台 が搭載されています。
E/Fは1983年、Mは1984年に発売されました。特にFモデルは当時としては珍しいFDD搭載モデルであり、価格も手軽だったこともあって、爆発的に売れ、買って損しないパソコン、とまで評価されたことがあります。
| PC-9801E | 215000円 | FDDは外付けであり内蔵不可。 |
| PC-9801F1 | 328000円 | 2DDのFDD1台内蔵、もう1台増設可能。 |
| PC-9801F2 | 398000円 | 2DDのFDD2台内蔵。 |
| PC-9801F3 | 758000円 | 2DDのFDD1台と10MBのHDD1台内蔵 |
Mモデルは、FシリーズのFDDを2HDのものに換えたことが相違点です。また、メモリも256KBに増量しました。これは、ライバルである富士通が2HDのFDDを搭載したFM16βを発売する情報があったため、対抗上間に合わせで登場させた、ともいわれています。
| PC-9801M2 | 415000円 | 2HDのFDD2台を内蔵 |
| PC-9801M3 | 838000円 | 2HDのFDD1台と20MBのHDDを内蔵 |
但し、2HDとは言っても、2HD/2DD両用ではないので、販売店で確かめてからソフトを買わないと対応できないことになります。実際に販売店でも混乱があったと言われています。この問題は、翌1984年にVMモデルが登場して解決することとなりました。
PC-9801E/F/Mのスペック
一部、漢字ROMや内蔵FDDの違いがある他は同じものでした。
| CPU | 8086-2を5MHz/8MHz切り換えて稼働。 |
| ROM | N88-BASIC(86)及びモニタ96KB。 |
| RAM |
メインRAM：128KB。但し、F3とM2/M3は256KB。 最大640KBまで拡張可。 ビデオRAM：192KB。 テキストRAM:12KB。 |
| テキスト表示 |
80×25行/80×20行/40×25行/40×20行 切り換えて使用（8色表示）。 |
| グラフィックス表示 |
640×400ドット2画面8色表示 640×200ドット4画面8色表示 |
| 漢字表示 |
JIS第1水準漢字ROM搭載 （Eはオプション、F/Mは標準搭載） JIS第2水準漢字ROM、拡張漢字ROM（オプション） |
|
インタフェース （I/F） |
シリアル：RS232C プリンタ：セントロニクス社仕様 8インチFDD外付け用I/F：オプション 5.25インチFDD外付け用I/F 2DD/2D（Eは2Dのみ） カセット（CMT）：オプション（300ボー/1200ボー） |
| CRT接続 |
デジタルCRT モノクロディスプレイ（ライトペン接続可） |
| サウンド | BEEP音（オプションでFM音源/SSG音源搭載可） |
| 拡張スロット |
16ビットのCバス Eは6個、F1/F2は4個、M2は3個、F3/M3は2個 |
| 内蔵FDDとHDD |
Fは2DDのFDDを搭載（F1/F3は1台、F2は2台） Mは2HDのFDDを搭載（M2は2台、M3は1台） F3とM3には10MBのHDD（SASI）を内蔵 |
※当時のNECでは、ハードディスク（HDD）を固定ディスク装置と呼んでいました。
